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组织解离液的选择与优化:从原代细胞分离到单细胞测序

更新时间:2025-12-04点击次数:350
  在现代生物医学研究中,原代细胞的获取是连接组织样本与下游功能分析(如单细胞RNA测序)的关键第一步。而组织解离液——即用于将实体组织分解为单细胞悬液的酶混合物或化学试剂——其选择与优化直接决定了细胞得率、活性及转录组保真度。因此,合理设计解离方案已成为单细胞组学研究中的核心技术环节。
  不同组织类型因其细胞外基质(ECM)成分、细胞间连接强度及细胞类型组成差异,对解离条件的需求迥异。例如,肝脏富含胶原蛋白,需较高浓度的胶原酶;而脑组织神经元脆弱,应避免强机械剪切和长时间酶处理。常用的解离酶包括胶原酶(Collagenase)、胰蛋白酶(Trypsin)、分散酶(Dispase)、透明质酸酶(Hyaluronidase)以及DNase I(降解释放的DNA以降低黏度)。这些酶可单独使用,但更常见的是根据目标组织特性进行组合,形成定制化解离液。
  解离液的优化需兼顾效率与温和性。过度解离会损伤细胞膜、激活应激通路,甚至诱导凋亡相关基因表达,从而干扰单细胞测序结果的真实性;而解离不足则导致细胞团块残留,影响微流控平台的捕获效率。为此,研究者常通过预实验系统评估不同酶配比、作用时间、温度及机械辅助方式(如吹打、振荡)对细胞活力(通常以台盼蓝染色或流式检测Annexin V/PI判断)和得率的影响。
  近年来,商业化的组织解离试剂盒(如Miltenyi Biotec的Tumor Dissociation Kit、STEMCELL Technologies的Lung Dissociation Kit等)提供了标准化起点,但往往仍需针对特定样本进行微调。例如,在肿瘤微环境研究中,为保留免疫细胞亚群完整性,常在解离液中加入蛋白酶抑制剂或抗氧化剂以减少非特异性激活。此外,冷活性酶(cold-active proteases)的应用也逐渐兴起,可在4°C下实现温和解离,有效抑制应激基因表达。
  进入单细胞测序流程后,解离质量的影响更为显著。低质量的单细胞悬液不仅导致细胞捕获失败,还可能引入技术噪音。已有研究表明,解离过程中激活的FOS、JUN等即刻早期基因(IEGs)会在scRNA-seq数据中形成“假阳性”信号,误导细胞状态判读。因此,部分实验室采用RNA稳定性增强剂(如RNAlater)或在解离缓冲液中添加转录抑制剂(如Actinomycin D)以控制此类干扰,尽管后者需谨慎评估其对细胞活性的影响。
  组织解离液的选择并非“一刀切”,而是需结合组织来源、研究目的及下游技术平台进行系统优化。理想解离方案应在短时间内获得高活性、高纯度且转录组扰动最小的单细胞悬液。未来,随着人工智能辅助实验设计与高通量筛选平台的发展,解离条件的个性化定制将更加精准高效,为单细胞多组学研究提供坚实基础。

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