PI染液(1mg/mL)是一种常用的细胞核荧光染料,是溴化乙锭(EB)的类似物,能够嵌入DNA的碱基对间而结合,无显著的序列偏好,大约每4-5个碱基对结合一个染料分子。PI也可与RNA结合,为区分DNA与RNA染色,通常需添加核酸酶处理。PI水溶液的最大激发/发射波长为493/636 nm,但与核酸结合后,荧光信号增强20-30倍,且最大激发/发射波长变为535/617
DAPI染液是一种常用于细胞核染色的蓝色荧光染料,优先结合双链DNA,尤其是与小沟中的AT区域结合。此外,DAPI亦可结合RNA,但结合模式不同。与DNA复合物相比,DAPI/RNA复合物的荧光发射波长较长(约500 nm),而DAPI/DNA复合物的发射波长为约460 nm。
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